Заместитель руководителя Федеральной службы по надзору в сфере образования и науки с 30 апреля 2020 года, член Высшего Совета ЛДПР, депутат Государственной Думы VII и VIII созыва, член Совета по делам молодёжи при Патриархе Московском и Всея Руси.
Публичной поддержке российской военной агрессии против Украины. Борис Чернышов внесен в доклад "1500 поджигателей войны", составленный Форумом свободной России. В докладе содержатся фамилии российских публичных фигур, военных руководителей, депутатов, пропагандистов, артистов и спортсменов, которые публично высказались в поддержку путинской агрессии или непосредственно принимают в ней участие. Форум свободной России добивается введения санкций против них в Европейском союзе.