Член Совета Федерации, представитель Краснодарского края, член Комитета Совета Федерации по аграрно-продовольственной политике и природопользованию. До избрания занимал должность депутата Законодательного Собрания Краснодарского края, был председателем комитета Законодательного Собрания Краснодарского края.
Публичной поддержке российской военной агрессии против Украины. Алексей Кондратенко внесен в доклад "1500 поджигателей войны", составленный Форумом свободной России. В докладе содержатся фамилии российских публичных фигур, военных руководителей, депутатов, пропагандистов, артистов и спортсменов, которые публично высказались в поддержку путинской агрессии или непосредственно принимают в ней участие. Форум свободной России добивается введения санкций против них в Европейском союзе.