Член Совета Федерации, представитель Курганской области, член Комитета Совета Федерации по обороне и безопасности. До избрания занимал должность директора по развитию АО "Научно-производственное объединение "Курганприбор", был депутатом Курганской областной Думы седьмого созыва.
Публичной поддержке российской военной агрессии против Украины. Сергей Муратов внесен в доклад "1500 поджигателей войны", составленный Форумом свободной России. В докладе содержатся фамилии российских публичных фигур, военных руководителей, депутатов, пропагандистов, артистов и спортсменов, которые публично высказались в поддержку путинской агрессии или непосредственно принимают в ней участие. Форум свободной России добивается введения санкций против них в Европейском союзе.