Член Совета Федерации, представитель Ставропольского края, член Комитета Совета Федерации по федеративному устройству, региональной политике, местному самоуправлению и делам Севера. До избрания занимал должность Председателя Думы Ставропольского края.
Публичной поддержке российской военной агрессии против Украины. Геннадий Ягубов внесен в доклад "1500 поджигателей войны", составленный Форумом свободной России. В докладе содержатся фамилии российских публичных фигур, военных руководителей, депутатов, пропагандистов, артистов и спортсменов, которые публично высказались в поддержку путинской агрессии или непосредственно принимают в ней участие. Форум свободной России добивается введения санкций против них в Европейском союзе.